Лабораторная диагностика гриппа и ОРВИ

Год: Неделя:


Данные за неделю с 11.02.2019 по 17.02.2019

Результаты диагностики гриппа
 
- Нет данных
- Не выявлено
- H1pdm09
- H1pdm09+H1
- H1pdm09+B
- H1pdm09+B+H1
- H1pdm09+H3
- H1pdm09+H3+H1
- H1pdm09+H3+B
- H1pdm09+H3+H1+B
- H1
- B
- B+H1
- H3
- H3+H1
- H3+B
- H3+H1+B


Выделение вирусов гриппа



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  


Результаты иммунофлуоресцентной (ИФ) диагностики



  - B - A(H1N1) + A(H1N1)pdm09 - A(H3N2)  
  - PIV - AD - RS  


Результаты RT-PCR диагностики



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  
  - PIV - AD - RS    


Общее количество случаев гриппа


Таблица 1. Выделение вирусов
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во выделенных вырусов
H1 H3 B H1pdm09 Нети-
пир.
Всего
БЛ НИИГ (абс)285028065093
(%) 0,09,80,022,80,032,6
БЛ ИВ (абс)13500057057
(%) 0,00,00,042,20,042,2
ВСЕГО (абс)42002801220150
(%) 0,06,70,029,00,035,7

Таблица 2. Иммунофлуоресцентная диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп Парагрипп AD RS Всего
H1+H1pdm09 H3 B I II III
БЛ НИИГ (абс)16381043013981338762437
(%) 6,31,80,062,44,92,05,33,826,7
БЛ ИВ (абс)1721518025107562
(%) 8,710,50,01,22,95,84,12,936,0
ВСЕГО (абс)18101194814186439467499
(%) 6,62,70,062,34,82,45,23,727,6

Таблица 3. ПЦР-диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп ПГ AD RS
A
(субтип не определен)
H1 H3 H5 B H1pdm09
БЛ НИИГ (абс)5735333 / 57350 / 0716 / 57290 / 249617 / 5735805 / 573232 / 407233 / 3764111 / 3808
(%) 5,8-12,50,00,314,00,80,92,9
БЛ ИВ (абс)7560 / 7560 / 0103 / 7560 / 531 / 756126 / 7566 / 4869 / 4868 / 486
(%) 0,0-13,60,00,116,71,21,91,6
ВСЕГО (абс)6491333 / 64910 / 0819 / 64850 / 254918 / 6491931 / 648838 / 455842 / 4250119 / 4294
(%) 5,1-12,60,00,314,30,81,02,8

Таблица 4. Общее количество случаев гриппа
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во диагностированных случаев гриппа
H1 H1+H1pdm09
(по данным ИФ)
H3 A
(субтип не определен)
B H1pdm09 Кол-во
диаг.
БЛ НИИГ (абс)67170104738324189121992
(%) 0,01,511,04,80,313,629,7
БЛ ИВ (абс)84001510801128237
(%) 0,01,812,90,00,115,228,2
ВСЕГО (абс)755701198463241910402229
(%) 0,01,611,24,30,313,829,5

Заключение

На 7 неделе 2019 г. уровень заболеваемости населения в целом по стране понизился до 95.8 на 10 000 населения и стал выше базовой линии (72.2) на 32.7% и выше еженедельного эпидемического порога - на 23.9%.

Лабораторными методами на 7 неделе при исследовании материалов от 7557 больных гриппом и ОРВИ в 52 городах зарегистрировано 2229 (29.5%) случаев гриппа, в том числе 1040 случаев гриппа A(H1N1)pdm09 в 51 городах, 846 случаев гриппа A(H3N2) в 50 городах, 324 случая гриппа А в 10 городах и 19 случаев гриппа В в 10 городах.

На 7 неделе выделено 150 вирусов, в том числе 122 вируса A(H1N1)pdm09 в Архангельске (2), Астрахани (1), Владивостоке (40),  Воронеже (1), Екатеринбурге (3), Калининграде (6), Красноярске (1), Москве (22), Новосибирске (4),Самаре (4), Оренбурге (3), Санкт-Петербурге (27), Улан-Уде (1), Чите (3), Якутске (4); 28 вирусов гриппа A(H3N2) в Архангельске (5), Калининграде (1), Новосибирске (8), Санкт-Петербурге (10), Улан-Уде (1) и Чите (3). Всего с начала сезона изолировано 546 вирусов гриппа, в том числе 432 - А(H1N1)pdm09, 111 - A(H3N2) и 3 вируса гриппа типа В.

Антигенная характеристика. С начала сезона в НЦГ (Санкт-Петербург, Москва) антигенно охарактеризовано 193 вируса гриппа, в том числе 152 вируса гриппа А(H1N1)pdm09, 40 вирусов A(H3N2) и 1 штамм вируса гриппа типа В. Все вирусы гриппа А(H1N1)pdm09 были близкородственны современному вакцинному штамму А/Мичиган/45/2015, вирусы A(H3N2) - современному вакцинному штамму A/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016, вирус гриппа В был отнесен к линии Виктория и подобен современному вакцинному штамму В/Колорадо/06/2017.

Генетический анализ.  С начала сезона в Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) проанализирован 101 вирус гриппа, в том числе: 58 вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, 42 штамма вируса гриппа A(H3N2) и 1 вирус гриппа типа В. По данным генетического анализа вирусы гриппа A(H1N1)pdm09 относились к генетической подгруппе 6В.1 и подобны вакцинному штамму А/Мичиган/45/2015(H1N1)pdm09. Все исследованные штаммы подтипа А(H3N2) принадлежали к генетической подгруппе 3C.2a1b (референс штамм A/Alsace/1746/2018). 1 вирус гриппа типа В, выделенный в Архангельске, относится к линии Виктория, подгруппе V1A.1, имеет делецию двух аминокислот (162-163) в гемагглютинине и подобен современному вакцинному штамму В/ Колорадо/06/2017.

Все проанализированные вирусы гриппа типа А обладали чувствительностью к ингибиторам нейраминидазы. Вирус гриппа типа В имел сниженную чувствительность к озельтамивиру.

ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 10.7%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 18.3%.

В системе Сигнального надзора с помощью ПЦР обследовано 62 больных ТОРИ, грипп выявлен в 17 (27.4%) случаях, в том числе 12 случаев гриппа A(H1N1)pdm09: в Липецке (1), в Санкт-Петербурге (2), во Владивостоке (2), в Новосибирске (6), в Чите (1); 5 случаев гриппа A(H3N2): в Санкт-Петербурге (2), во Владивостоке (1) и в Новосибирске (2).

5 (8.1%) случаев ТОРИ были обусловлены вирусами ОРВИ, в том числе 1 - респираторно-синцитиальной, 1 - бокавирусной , 1 - коронавирусной, 1 - метапневмовирусной и 1 - риновирусной инфекцией.

При обследовании 45 амбулаторных больных ГПЗ/ОРИ грипп диагностирован в 12 (26.7%) случаях, в том числе грипп А(H1N1)pdm09 в 6, грипп А(H3N2) - в 6 случаях. Расшифровано 6 (13.3%) случаев заболеваний негриппозной этиологии, в том числе: 2 - парагриппозной, 1 - аденовирусной. 1 - респираторно-синцитиальной, 1 - коронавирусной и 1 -  риновирусной инфекцией.