Лабораторная диагностика гриппа и ОРВИ

Год: Неделя:


Данные за неделю с 08.10.2018 по 14.10.2018

Результаты диагностики гриппа
 
- Нет данных
- Не выявлено
- H1pdm09
- H1pdm09+H1
- H1pdm09+B
- H1pdm09+B+H1
- H1pdm09+H3
- H1pdm09+H3+H1
- H1pdm09+H3+B
- H1pdm09+H3+H1+B
- H1
- B
- B+H1
- H3
- H3+H1
- H3+B
- H3+H1+B


Выделение вирусов гриппа



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  


Результаты иммунофлуоресцентной (ИФ) диагностики



  - B - A(H1N1) + A(H1N1)pdm09 - A(H3N2)  
  - PIV - AD - RS  


Результаты RT-PCR диагностики



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  
  - PIV - AD - RS    


Общее количество случаев гриппа


Таблица 1. Выделение вирусов
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во выделенных вырусов
H1 H3 B H1pdm09 Нети-
пир.
Всего
БЛ НИИГ (абс)67000000
(%) 0,00,00,00,00,00,0
БЛ ИВ (абс)0000000
(%) ------
ВСЕГО (абс)67000000
(%) 0,00,00,00,00,00,0

Таблица 2. Иммунофлуоресцентная диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп Парагрипп AD RS Всего
H1+H1pdm09 H3 B I II III
БЛ НИИГ (абс)4930002025222333123
(%) 0,00,00,04,15,14,54,76,724,9
БЛ ИВ (абс)880004238421
(%) 0,00,00,04,52,33,49,14,523,9
ВСЕГО (абс)5810002427253137144
(%) 0,00,00,04,14,64,35,36,424,8

Таблица 3. ПЦР-диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп ПГ AD RS
A
(субтип не определен)
H1 H3 H5 B H1pdm09
БЛ НИИГ (абс)11780 / 11780 / 3061 / 4070 / 2550 / 11780 / 37530 / 79126 / 7916 / 791
(%) 0,00,00,20,00,00,03,83,30,8
БЛ ИВ (абс)1870 / 1870 / 00 / 00 / 00 / 1870 / 013 / 1544 / 1540 / 154
(%) 0,0---0,0-8,42,60,0
ВСЕГО (абс)13650 / 13650 / 3061 / 4070 / 2550 / 13650 / 37543 / 94530 / 9456 / 945
(%) 0,00,00,20,00,00,04,63,20,6

Таблица 4. Общее количество случаев гриппа
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во диагностированных случаев гриппа
H1 H1+H1pdm09
(по данным ИФ)
H3 A
(субтип не определен)
B H1pdm09 Кол-во
диаг.
БЛ НИИГ (абс)14600010001
(%) 0,00,00,070,00,00,00,07
БЛ ИВ (абс)2230000000
(%) 0,00,00,00,00,00,00,0
ВСЕГО (абс)16830010001
(%) 0,00,00,060,00,00,00,06

Заключение

На 41 неделе (с 08 по 14 октября 2018 г.) уровень заболеваемости населения в целом по стране понизился до 59.1 на 10 000 населения и оставался ниже базовой линии (72.6) на 18.6%, еженедельного эпидемического порога - на 11.8%.

Лабораторными методами на 41 неделе при исследовании материалов от 1683 больных гриппом и ОРВИ в 51 городе зарегистрирован 1 (0.06%) случай гриппа A(H3N2) в Хабаровске.

Антигенная характеристика. В прошедшем сезоне в НЦГ (Санкт-Петербург, Москва) антигенно охарактеризовано 1016 вирусов гриппа, в том числе 333 вируса А(H1N1)pdm09, 233 вируса гриппа А(H3N2) и 450 вирусов гриппа типа В. Все вирусы гриппа А(H1N1)pdm09 и А(H3N2) были близкородственны штаммам А/Мичиган/45/2015 и А/Гонконг/4801/2014, включенным в состав гриппозных вакцин на сезон 2017-2018 гг., за исключением одного штамма A(H3N2), со сниженной активностью в РТГА (до 1:16 гомологичного титра). 440 штаммов вируса гриппа типа В относились к линии Ямагата и были подобны референс-штамму В/Пхукет/3073/2013, 10 вирусов гриппа типа В отнесены к линии Виктория и были близко родственными референс-штамму В/Брисбен/60/2008.

Генетический анализ.  С начала сезона в Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) проанализированы 89 вирусов гриппа и ПЦР-положительных клинических образцов. 22 вируса гриппа А(H1N1)pdm09 были отнесены к филогенетической группе 6В.1. 22 из 33 вирусов гриппа А(H3N2) были отнесены к подгруппе 3С.2а, 11 вирусов А(H3N2) принадлежали к генетической подгруппе 3С.2а1 (референс-штамм А/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016). 32 вируса гриппа типа В  относились к линии Ямагата, клайду 3; 2 вируса гриппа типа В были отнесены к Викторианской линии, (генетический клайд 1А). 

5 вирусов гриппа А(H1N1)pdm09, выделенные в Москве, имели мутацию H275Y в нейраминидазе, свидетельствующую о резко сниженной чувствительности к озельтамивиру. Один штамм A(H1N1)pdm09, выделенный в Самаре, и вирус гриппа типа В, изолированный в Санкт-Петербурге, имели сниженную чувствительность к озельтамивиру по данным фенотипического анализа. Все остальные проанализированные вирусы были чувствительны к ингибиторам нейраминидазы. Все вирусы гриппа типа А были резистентны к ремантадину.

ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 33.8%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 24.8%.

В системе Сигнального надзора выявлено 29 случаев ТОРИ. С помощью ПЦР обследовано 29 больных ТОРИ, зарегистрирован 1 (3.4%) случай гриппа A(H1N1)pdm09  у больного 45 лет в Санкт-Петербурге. 6 (20.7%) случаев ТОРИ были обусловлены вирусами ОРВИ, в том числе: 1 - метапневмовирусной и 5 - риновирусной инфекцией.

При обследовании 33 амбулаторных больных ГПЗ/ОРИ грипп не диагностирован. Расшифровано 11 (33.3%) случаев заболеваний не гриппозной этиологии, в том числе: 1 - парагриппозной, 1 - респираторно-синцитиальной и 9 - риновирусной инфекцией.