Лабораторная диагностика гриппа и ОРВИ

Год: Неделя:


Данные за неделю с 26.11.2018 по 02.12.2018

Результаты диагностики гриппа
 
- Нет данных
- Не выявлено
- H1pdm09
- H1pdm09+H1
- H1pdm09+B
- H1pdm09+B+H1
- H1pdm09+H3
- H1pdm09+H3+H1
- H1pdm09+H3+B
- H1pdm09+H3+H1+B
- H1
- B
- B+H1
- H3
- H3+H1
- H3+B
- H3+H1+B


Выделение вирусов гриппа



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  


Результаты иммунофлуоресцентной (ИФ) диагностики



  - B - A(H1N1) + A(H1N1)pdm09 - A(H3N2)  
  - PIV - AD - RS  


Результаты RT-PCR диагностики



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  
  - PIV - AD - RS    


Общее количество случаев гриппа


Таблица 1. Выделение вирусов
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во выделенных вырусов
H1 H3 B H1pdm09 Нети-
пир.
Всего
БЛ НИИГ (абс)25000101
(%) 0,00,00,04,00,04,0
БЛ ИВ (абс)2000000
(%) 0,00,00,00,00,00,0
ВСЕГО (абс)27000101
(%) 0,00,00,03,70,03,7

Таблица 2. Иммунофлуоресцентная диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп Парагрипп AD RS Всего
H1+H1pdm09 H3 B I II III
БЛ НИИГ (абс)7493001431243836146
(%) 0,40,00,01,94,13,25,14,819,5
БЛ ИВ (абс)11330042720137
(%) 2,70,00,03,51,86,217,70,932,7
ВСЕГО (абс)8626001833315837183
(%) 0,70,00,02,13,83,66,74,321,2

Таблица 3. ПЦР-диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп ПГ AD RS
A
(субтип не определен)
H1 H3 H5 B H1pdm09
БЛ НИИГ (абс)18470 / 18470 / 5042 / 7210 / 4642 / 18472 / 66945 / 100328 / 103021 / 1004
(%) 0,00,00,30,00,10,34,52,72,1
БЛ ИВ (абс)1930 / 1930 / 330 / 330 / 330 / 1933 / 785 / 1653 / 16514 / 165
(%) 0,00,00,00,00,03,83,01,88,5
ВСЕГО (абс)20400 / 20400 / 5372 / 7540 / 4972 / 20405 / 74750 / 116831 / 119535 / 1169
(%) 0,00,00,30,00,100,74,32,63,0

Таблица 4. Общее количество случаев гриппа
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во диагностированных случаев гриппа
H1 H1+H1pdm09
(по данным ИФ)
H3 A
(субтип не определен)
B H1pdm09 Кол-во
диаг.
БЛ НИИГ (абс)221403202610
(%) 0,00,10,090,00,090,30,5
БЛ ИВ (абс)2630300033
(%) 0,01,10,00,00,01,11,1
ВСЕГО (абс)247706202913
(%) 0,00,20,080,00,080,40,5

Заключение

На 48 неделе (с 26 ноября по 02 декабря 2018 г.) уровень заболеваемости населения в целом по стране повысился до 63.9 на 10 000 населения, но оставался ниже базовой линии (72.6) на 12.0%, а еженедельного эпидемического порога - на 3.0%.

Лабораторными методами на 48 неделе при исследовании материалов от 2477 больных гриппом и ОРВИ в 52 городах зарегистрировано 13 (0.5%) случаев гриппа в 6 городах, в том числе 9 случаев гриппа A(H1N1)pdm09 в Липецке, Самаре и Санкт-Петербурге, 2 случая гриппа A(H3N2) в Волгограде и Якутске и 2 случая гриппа типа В в Белгороде.

На 48 неделе выделен один вирус гриппа A(H1N1)pdm09 в Санкт-Петербурге (НИИ гриппа), подобный вакцинному штамму на сезон 2018-2019 годов А/Мичиган/45/2015.

Антигенная характеристика. В прошедшем сезоне в НЦГ (Санкт-Петербург, Москва) антигенно охарактеризовано 1016 вирусов гриппа, в том числе 333 вируса А(H1N1)pdm09, 233 вируса гриппа А(H3N2) и 450 вирусов гриппа типа В. Все вирусы гриппа А(H1N1)pdm09 и А(H3N2) были близкородственны штаммам А/Мичиган/45/2015 и А/Гонконг/4801/2014, включенным в состав гриппозных вакцин на сезон 2017-2018 гг., за исключением одного штамма A(H3N2), со сниженной активностью в РТГА (до 1:16 гомологичного титра). 440 штаммов вируса гриппа типа В относились к линии Ямагата и были подобны референс-штамму В/Пхукет/3073/2013, 10 вирусов гриппа типа В отнесены к линии Виктория и были близко родственными референс-штамму В/Брисбен/60/2008.

Генетический анализ.  В прошедшем сезоне в Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) проанализированы 246 вирусов гриппа и ПЦР-положительных клинических образцов. 94 вируса гриппа А(H1N1)pdm09 были отнесены к филогенетической группе 6В.1. 59 из 93 вирусов гриппа А(H3N2) были отнесены к подгруппе 3С.2а2 (референс-штамм А/Швейцария/8060/2017), 29 вирусов А(H3N2) принадлежали к генетической подгруппе 3С.2а1 (референс-штамм А/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016), 5 вирусов A(H3N2) принадлежали к группе 3С.2а3. 54 вируса гриппа типа В  относились к линии Ямагата, клайду 3; 5 вирусов гриппа типа В были отнесены к Викторианской линии, (генетический клайд 1А). 

5 вирусов гриппа А(H1N1)pdm09, выделенные в Москве и Самаре, имели мутацию H275Y в нейраминидазе, свидетельствующую о резко сниженной чувствительности к озельтамивиру. Все остальные проанализированные вирусы были чувствительны к ингибиторам нейраминидазы.Один штамм вируса гриппа A(H1N1)pdm09, выделенный в Иркутске, был чувствительным к ремантадину. Все остальные вирусы гриппа типа А были резистентны к ремантадину.

ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 32.0%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 20.5%.

В системе Сигнального надзора с помощью ПЦР обследовано 47 больных ТОРИ, зарегистрирован один случай гриппа A(H1N1)pdm09 в Самаре у ребенка 6 лет. 10 (21.3%) случаев ТОРИ были обусловлены вирусами ОРВИ, в том числе: 3 - парагриппозной, 3 - респираторно-синцитиальной,1 - бокавирусной и 3 - риновирусной инфекцией.

При обследовании 50 амбулаторных больных ГПЗ/ОРИ грипп диагностирован в 3 (6.0%) случаях, в том числе 2 случая гриппа A(H1N1)pdm09 в Липецке и 1 случай гриппа A(H3N2) в Калининграде. Расшифровано 18 (36.0%) случаев заболеваний негриппозной этиологии, в том числе: 3 - парагриппозной, 6 - аденовирусной, 1 - метапневмовирусной, 2 - бокавирусной и 6 - риновирусной инфекцией.