Лабораторная диагностика гриппа и ОРВИ

Год: Неделя:


Данные за неделю с 07.05.2012 по 13.05.2012

Результаты диагностики гриппа
 
- Нет данных
- Не выявлено
- H1pdm09
- H1pdm09+H1
- H1pdm09+B
- H1pdm09+B+H1
- H1pdm09+H3
- H1pdm09+H3+H1
- H1pdm09+H3+B
- H1pdm09+H3+H1+B
- H1
- B
- B+H1
- H3
- H3+H1
- H3+B
- H3+H1+B


Выделение вирусов гриппа

На отчетной неделе по данным на 15.05.12 вирусы гриппа были выделены в 6 городах - базовых лабораториях ФЦГ и ЦЭЭГ (БЛ). По результатам тестирования 203 клинических материалов от больных гриппом и ОРВИ было выделено 20 (9.9%) вирусов гриппа, в том числе 6 (3.0%) вирусов гриппа А(Н3N2) в Новосибирске и Улан-Уде и 14 (6.9%) вирусов гриппа типа В в Санкт-Петербурге, Хабаровске, Москве и Томске (табл. 1).

Проведен антигенный анализ 210 штаммов, в том числе 5 вирусов А(Н1N1)pdm09, 142 вирусов А(Н3N2) и 63 вирусов гриппа В. Вирусы гриппа А(Н1N1)pdm09 были антигенно родственными штамму А/Калифорния /07/09, гриппа А(Н3N2) - референс-штаммам А/Виктория/208/09 или А/Перт/16/09.

11 вирусов гриппа В, выделенных в Новосибирске, Санкт-Петербурге, Архангельске, Москве и Владивостоке, относились к Ямагатской линии и по антигенной структуре были родственными вирусу В/Висконсин/1/10, рекомендованному в состав гриппозных вакцин на сезон 2012-2013 гг. или референс-штамму В/Флорида/4/06. 52 вируса гриппа В, выделенные в разных городах страны, относились к Викторианской линии и по антигенной структуре были родственными вирусу В/Брисбен/60/08, входящему в состав гриппозных вакцин на текущий сезон.

Генетический анализ показал принадлежность 20 вирусов А(Н3N2) к группе A/Stockholm/18/2011 клайда A/Victoria/208/2009, 2 вируса А(Н3N2) были отнесены  к группе А/Ирак/7/11. Bирус гриппа A(H1N1)pdm09  был отнесен к новой группе A/Санкт-Петербург/27/2011. Четыре вируса гриппа типа В принадлежали к Ямагатской линии, клайду В/Бангладеш/3333/2007, 1 вирус гриппа В - к  Викторианской линии, клайду В/Брисбан/60/2008.

Чувствительность к антивирусным препаратам. В результате генетического анализа 42 вирусов гриппа А(Н3N2), 3 вирусов A(H1N1)pdm09 и 5 вирусов гриппа типа В показано, что, все вирусы оказались чувствительными к озельтамивиру. По результатам флуометрического теста (Munana) документирована чувствительность всех 42 вирусов гриппа А(Н3N2) и 5 вирусов гриппа типа В к озельтамивиру. Установлена резистентность к ремантадину  всех исследованных вирусов гриппа А(Н3N2) (47 штаммов).



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  


Результаты иммунофлуоресцентной (ИФ) диагностики

Согласно данным ИФ обследования 574 клинических материалов от больных ОРВИ в 33 БЛ ФЦГ и 7 БЛ ЦЭЭГ было диагностировано:

32 (5.6%) случая гриппа А(Н3N2) в 8 городах, расположенных в 4 Федеральных округах (ФО) РФ,

5 (0.9%) случаев гриппа В в 4 городах 3 ФО.

Общая частота ИФ распознавания природы ОРВИ не гриппозной этиологии на этой неделе составила 13.2%, из них парагриппозной - 6.1%, аденовирусной - 4.5%, РС-вирусной - 2.6% случаев от числа обследованных больных, соответственно (табл. 2).



  - B - A(H1N1) + A(H1N1)pdm09 - A(H3N2)  
  - PIV - AD - RS  


Результаты RT-PCR диагностики

ПЦР-диагностика проведена в 29 БЛ ФЦГ и 9 БЛ ЦЭЭГ. По результатам анализа материалов выявлено:

- 2 (0.6%) случая гриппа А(Н1N1)pdm09 в Санкт-Петербурге,

- 35 (9.6%) случаев гриппа A(H3N2) в 14 городах 5 Федеральных округов,

- 12 (2.4%) случаев гриппа В в 7 городах 5 Федеральных округов,

- 5 (1.2%) случаев не субтипированного гриппа А в 3 городах.

Общая частота ПЦР распознавания ОРВИ не гриппозной этиологии на этой неделе составила 7.7%, из них парагриппозной - 5.2%, аденовирусной - 1.4% и РС-вирусной - 1.1% от числа обследованных больных (табл. 3). 



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  


Общее количество случаев гриппа

Сводные результаты диагностирования гриппа поступили из 48 БЛ, а также из ФЦГ и ЦЭЭГ. В результате анализа клинических материалов от 912 больных грипп диагностирован в 7.6% случаев, в том числе грипп А(Н1N1)pdm09 -  в 0.2%, грипп A(H3N2) - в 5.0%, не субтипированный грипп А - в 0.2%грипп В - в 2.1% случаев от числа обследованных больных (табл. 4).


Таблица 1. Выделение вирусов
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во выделенных вырусов
H1 H3 B H1pdm09 Нети-
пир.
Всего
БЛ НИИГ (абс)1840640010
(%) 0,03,32,20,00,05,4
БЛ ИВ (абс)1900100010
(%) 0,00,052,60,00,052,6
ВСЕГО (абс)20306140020
(%) 0,03,06,90,00,09,9

Таблица 2. Иммунофлуоресцентная диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп Парагрипп AD RS Всего
H1+H1pdm09 H3 B I II III
БЛ НИИГ (абс)5420325183112413106
(%) 0,05,90,93,30,62,04,42,419,6
БЛ ИВ (абс)32000012227
(%) 0,00,00,00,03,16,36,36,321,9
ВСЕГО (абс)5740325184132615113
(%) 0,05,60,93,10,72,34,52,619,7

Таблица 3. ПЦР-диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп ПГ AD RS
A
(субтип не определен)
H1 H3 H5 B H1pdm09
БЛ НИИГ (абс)4265 / 4260 / 24932 / 3480 / 1268 / 4232 / 28315 / 2222 / 2273 / 219
(%) 1,20,09,20,01,90,76,80,91,4
БЛ ИВ (абс)800 / 00 / 03 / 150 / 04 / 800 / 800 / 652 / 650 / 65
(%) --20,0-5,00,00,03,10,0
ВСЕГО (абс)5065 / 4260 / 24935 / 3630 / 12612 / 5032 / 36315 / 2874 / 2923 / 284
(%) 1,20,09,60,02,40,65,21,41,1

Таблица 4. Общее количество случаев гриппа
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во диагностированных случаев гриппа
H1 H1+H1pdm09
(по данным ИФ)
H3 A
(субтип не определен)
B H1pdm09 Кол-во
диаг.
БЛ НИИГ (абс)8160043215262
(%) 0,00,05,30,21,80,27,6
БЛ ИВ (абс)960030407
(%) 0,00,03,10,04,20,07,3
ВСЕГО (абс)9120046219269
(%) 0,00,05,00,22,10,27,6

Заключение

На 20 неделе уровень регистрируемой заболеваемости населения продолжал понижаться (в среднем по стране до 34.7 на 10 000 населения) и стал ниже базовой линии для России в целом на 47.8%. Превышение эпидемического порога для всего населения на 41.1% было зарегистрировано в  Магадане. Суммарная частота диагностирования гриппа на этой неделе в России составила 7.6% от числа обследованных больных, в том числе гриппа A(H3N2) - 5.0%, гриппа А(Н1N1)pdm09 - 0.2%, не субтипированного гриппа А - 0.2%, гриппа В - 2.1%

Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии в целом по стране составила 7.7% (ПЦР) и 13.2% (ИФ) от числа обследованных больных.

Проведен антигенный анализ 210 штаммов, в том числе 5 вирусов А(Н1N1)pdm09, 142 вирусов А(Н3N2) и 63 вирусов гриппа В. Вирусы гриппа А(Н1N1)pdm09 были антигенно родственными штамму А/Калифорния /07/09, гриппа А(Н3N2) - референс-штаммам А/Виктория/208/09 или А/Перт/16/09.

11 вирусов гриппа В, выделенных в Новосибирске, Санкт-Петербурге, Архангельске, Москве и Владивостоке, относились к Ямагатской линии и по антигенной структуре были родственными вирусу В/Висконсин/1/10, рекомендованному в состав гриппозных вакцин на сезон 2012-2013 гг. или референс-штамму В/Флорида/4/06. 52 вируса гриппа В, выделенные в разных городах страны, относились к Викторианской линии и по антигенной структуре были родственными вирусу В/Брисбен/60/08, входящему в состав гриппозных вакцин на текущий сезон.

Генетический анализ показал принадлежность 20 вирусов А(Н3N2) к группе A/Stockholm/18/2011 клайда A/Victoria/208/2009, 2 вируса А(Н3N2) были отнесены  к группе А/Ирак/7/11. Bирус гриппа A(H1N1)pdm09  был отнесен к новой группе A/Санкт-Петербург/27/2011. Четыре вируса гриппа типа В принадлежали к Ямагатской линии, клайду В/Бангладеш/3333/2007, 1 вирус гриппа В - к  Викторианской линии, клайду В/Брисбан/60/2008.

Чувствительность к антивирусным препаратам. В результате генетического анализа 42 вирусов гриппа А(Н3N2), 3 вирусов A(H1N1)pdm09 и 5 вирусов гриппа типа В показано, что, все вирусы оказались чувствительными к озельтамивиру. По результатам флуометрического теста (Munana) документирована чувствительность всех 42 вирусов гриппа А(Н3N2) и 5 вирусов гриппа типа В к озельтамивиру. Установлена резистентность к ремантадину  всех исследованных вирусов гриппа А(Н3N2) (47 штаммов).

 

ФЦГ и ЦЭЭГ просят в срочном порядке выслать все вновь выделенные вирусы гриппа для их углубленного антигенного и генетического анализа.