Обучающий семинар GISAID-WHO, Санкт–Петербург, Россия, 28–29 августа 2014

28–29 августа 2014 года г. Санкт–Петербурге, Россия, в гостинице «Октябрьская» состоялся обучающий семинар GISAID-WHO. Семинар был организован совместно ФГБУ «НИИ гриппа» Минздрава России, GISAID и Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) при поддержке Министерства сельского хозяйства Германии (BMEL).

В двухдневном семинаре приняло участие 39 специалистов лабораторий, занимающимся исследованиями вирусов гриппа, из стран СНГ и Балтии. Обучение проводилось на английском языке с синхронным переводом на русский в форме лекций и практических занятий преподавателями из научно–исследовательских учреждений Великобритании, Германии, Сингапура и Италии, а также НИИ гриппа. Во время обучения была представлена новая версия базы данных GISAID EpiFlu 2.0 (информационная брошюра, PDF), её свойства и возможности. Инструмент FluSurver, интегрированный в платформу GISAID, позволит оценить функциональную значимость мутаций (влияние на связывание с рецептором, антигенные свойства, чувствительность к противовирусным препаратам) даже тем, кто не является специалистом в молекулярной биологии. Благодаря полученным в процессе семинара знаниям и умениям специалисты смогут воспользоваться сводными данными о эпидемиологии вирусов гриппа человека и животных и возникновении новых генетических и антигенных вариантов вирусов. По итогам занятий участники семинара были награждены именными сертификатами.

Программа семинара включала в себя вводные лекции на тему:

  • эволюция вирусов гриппа человека и животных секвенирование
  • база данных GISAID: компоненты и инструментарий
  • подача и курирование данных анализ последовательностей: сравнение/филогения анализ мутаций – фенотипические/функциональные последствия (связывание рецептора, антигенные свойства, устойчивость к противовирусным препаратам)

а также практические демонстрации на тему:

  • доступ и отправка данных
  • выравнивание последовательностей и построение филогенетических деревьев
  • анализ мутаций – частота и значение