Лабораторная диагностика гриппа и ОРВИ

Год: Неделя:


Данные за неделю с 15.04.2019 по 21.04.2019

Результаты диагностики гриппа
 
- Нет данных
- Не выявлено
- H1pdm09
- H1pdm09+H1
- H1pdm09+B
- H1pdm09+B+H1
- H1pdm09+H3
- H1pdm09+H3+H1
- H1pdm09+H3+B
- H1pdm09+H3+H1+B
- H1
- B
- B+H1
- H3
- H3+H1
- H3+B
- H3+H1+B


Выделение вирусов гриппа



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  


Результаты иммунофлуоресцентной (ИФ) диагностики



  - B - A(H1N1) + A(H1N1)pdm09 - A(H3N2)  
  - PIV - AD - RS  


Результаты RT-PCR диагностики



  - B - A(H1N1) - A(H3N2) - A(H1N1)pdm09  
  - PIV - AD - RS    


Общее количество случаев гриппа


Таблица 1. Выделение вирусов
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во выделенных вырусов
H1 H3 B H1pdm09 Нети-
пир.
Всего
БЛ НИИГ (абс)98021508
(%) 0,02,01,05,10,08,2
БЛ ИВ (абс)5605011016
(%) 0,08,90,019,60,028,6
ВСЕГО (абс)15407116024
(%) 0,04,50,610,40,015,6

Таблица 2. Иммунофлуоресцентная диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп Парагрипп AD RS Всего
H1+H1pdm09 H3 B I II III
БЛ НИИГ (абс)6368212828185427166
(%) 1,30,30,24,44,42,88,54,226,1
БЛ ИВ (абс)1260111158623
(%) 0,00,80,80,80,84,06,34,818,3
ВСЕГО (абс)7628322929236233189
(%) 1,00,40,33,83,83,08,14,324,8

Таблица 3. ПЦР-диагностика
Город Общ.
число
обсл.
Грипп ПГ AD RS
A
(субтип не определен)
H1 H3 H5 B H1pdm09
БЛ НИИГ (абс)194011 / 19400 / 049 / 17070 / 68716 / 194034 / 135075 / 146919 / 1469119 / 1506
(%) 0,6-2,90,00,82,55,11,37,9
БЛ ИВ (абс)2412 / 2410 / 026 / 2230 / 244 / 2412 / 1417 / 1354 / 1355 / 135
(%) 0,8-11,70,01,71,45,23,03,7
ВСЕГО (абс)218113 / 21810 / 075 / 19300 / 71120 / 218136 / 149182 / 160423 / 1604124 / 1641
(%) 0,6-3,90,00,92,45,11,47,6

Таблица 4. Общее количество случаев гриппа
Город Общ.
число
обсл.
Кол-во диагностированных случаев гриппа
H1 H1+H1pdm09
(по данным ИФ)
H3 A
(субтип не определен)
B H1pdm09 Кол-во
диаг.
БЛ НИИГ (абс)23580851111741120
(%) 0,00,32,20,50,71,75,1
БЛ ИВ (абс)327002705234
(%) 0,00,08,30,01,50,610,4
ВСЕГО (абс)26850878112243154
(%) 0,00,32,90,40,81,65,7

Заключение

На 16 неделе 2019 г. уровень заболеваемости населения в целом по стране понизился до 52.1 на 10 000 населения и стал ниже базовой линии (72.2) на 27.9% и ниже еженедельного эпидемического порога - на 23.8%.

Лабораторными методами на 16 неделе при исследовании материалов от 2685 больных гриппом и ОРВИ в 54 городах зарегистрировано 154 (5.7%) случая гриппа, в том числе 43 случая гриппа A(H1N1)pdm09 в 16 городах, 78 случаев гриппа A(H3N2) в 25 городах, 11 случаев гриппа А в 3 городах и 22 случая гриппа В в 12 городах.

На 16 неделе выделено 24 вируса, в том числе 16 вирусов A(H1N1)pdm09 во Владивостоке (1),  Москве (7), Омске (3), Оренбурге (3), Санкт-Петербурге (2); 7 вирусов гриппа A(H3N2) в Калининграде (1), Москве (5), Санкт-Петербурге (1) и 1 вирус гриппа типа В в Санкт-Петербурге. Всего с начала сезона изолировано 1280 вирусов гриппа, в том числе 854 - А(H1N1)pdm09, 408 - A(H3N2) и 18 вирусов гриппа типа В.

Антигенная характеристика. С начала сезона в НЦГ (Санкт-Петербург, Москва) антигенно охарактеризовано 620 вирусов гриппа, в том числе 410 вирусов гриппа А(H1N1)pdm09, 191 вирус A(H3N2) и 19 штаммов вируса гриппа типа В. Все вирусы гриппа А(H1N1)pdm09 были близкородственны современному вакцинному штамму А/Мичиган/45/2015, вирусы A(H3N2) - современному вакцинному штамму A/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016, при этом 12 вирусов, выделенные в Москве, реагировали с антисывороткой к референс-штамму до 1:8 и менее гомологичного титра. 6 вирусов гриппа В были отнесены к линии Виктория и подобны современному вакцинному штамму В/Колорадо/06/2017, 13 вирусов - к линии Ямагата и подобны референс-вирусу В/Пхукет/3073/2013.

Генетический анализ.  С начала сезона в Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) проанализировано 205 вирусов гриппа, типа А в том числе: 107 вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, 98 штаммов вируса гриппа A(H3N2) и 6 вирусов гриппа типа В. По данным генетического анализа вирусы гриппа A(H1N1)pdm09 относились к генетической подгруппе 6В.1 и подобны вакцинному штамму А/Мичиган/45/2015(H1N1)pdm09. Все исследованные штаммы подтипа А(H3N2) принадлежали к генетической подгруппе 3C.2a1b (референс штамм A/Alsace/1746/2018). 2 вируса гриппа типа В, относятся к линии Виктория, подгруппе V1A.1, имели делецию двух аминокислот (162-163) в гемагглютинине и подобны современному вакцинному штамму В/Колорадо/06/2017, 4 вируса гриппа В принадлежат к линии Ямагата, клайду 3.

Все проанализированные вирусы гриппа типа А обладали чувствительностью к ингибиторам нейраминидазы. Один вирус гриппа типа В имел сниженную чувствительность к озельтамивиру.

ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 27.8%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 23.1%.

В системе Сигнального надзора с помощью ПЦР обследовано 48 больных ТОРИ, грипп типа В выявлен в 1 (2.1%) случае в Санкт-Петербурге у ребенка возрастной группы 1-4 года .

13 (27.1%) случаев ТОРИ были обусловлены вирусами ОРВИ, в том числе вирусом парагрипа - 1,  респираторно-синцитиальным вирусом - 8, коронавирусом – 1, метапневмовирусом – 1, риновирусом - 2 случая.

При обследовании 49 амбулаторных больных ГПЗ/ОРИ грипп A(H3N2) диагностирован в 3 (6.1%) случаях. Расшифровано 10 (20.4%) случаев заболеваний негриппозной этиологии, в том числе 4 - парагриппозной, 1 - коронавирусной и 5 - риновирусной инфекцией.