Еженедельный бюллетень по гриппу

ЕЖЕНЕДЕЛЬНЫЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ БЮЛЛЕТЕНЬ ПО ГРИППУ И ОРВИ

за 19 неделю 2020 года.(04.05.20 - 10.05.20)

Ситуация в России

Резюме

На 19 неделе 2020 г. уровень заболеваемости населения в целом по стране понизился, по сравнению с предыдущей неделей и, составив 20.2 на 10 000 населения, был ниже базовой линии (72.4) на 72.0% и ниже еженедельного эпидемического порога на 56.4%.

Лабораторными методами на 19 неделе при исследовании материалов от 1563 больных гриппом и ОРВИ в 35 городах зарегистрировано 5 (0.3%) случаев гриппа в 4 городах, в том числе 2 случая гриппа A(H1N1)pdm09 в 2 городах, 1 случай гриппа типа A(H3N2) в 1 городе и 2 случая гриппа типа В в 1 городе.

На 19 неделе в клеточной культуре МDCK выделено 16 вирусов гриппа, в том числе 7 вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, 3 вируса гриппа A(H3N2) и 6 вирусов гриппа типа В. Всего с начала сезона выделено 1316 вирусов гриппа, в том числе 500 вирусов А(H1N1)pdm09, 253 вирусов A(H3N2) и 563 вируса гриппа типа В.

Антигенная характеристика. С начала сезона в НЦГ в Москве и Санкт-Петербурге антигенно охарактеризовано 736 вирусов гриппа, в том числе 320 вирусов A(H1N1)pdm09, 111 вирусов A(H3N2) и 305 вирусов гриппа типа В, выделенных в разных городах страны. Все штаммы A(H1N1)pdm09 антигенно подобны современному вакцинному штамму A/Brisbane/02/2018, за исключением 8 вирусов гриппа A(Н1N1)pdm09, взаимодействующих с антисывороткой к вакцинному штамму в сниженных титрах; 88 вирусов гриппа A(H3N2) были подобны референс-штамму A/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016, 4 штамма - его дрейф варианты, 4 вируса близкородственны современному вакцинному штамму А/Канзас/14/2017. 302 вируса гриппа В принадлежали Викторианской линии, 39 из них были антигенно близкородственны вакцинному штамму В/Колорадо/06/2017, 41 штамм оказался его дрейф-вариантом, 202 вируса были подобны вакцинному штамму  В/Вашингтон/02/2019, 20 штаммов определены как его дрейф-варианты. 3 вируса гриппа типа В были отнесены к линии Ямагата и подобны референс штамму В/Пхукет/3073/2013.

Генетический анализ.  В Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) отсеквенировано 442 вируса гриппа. По данным филогенетического анализа 244 вируса гриппа A(H1N1)pdm09 были отнесены к генетической подгруппе 6B.1A5 (референс-штамм A/Норвегия/3433/2018), 1 вирус – к генетической подгруппе 6B.1A7 (референс-штамм А/Словения/1489/2019). 21 вирус гриппа подтипа A(H3N2) отнесен к генетической подгруппе 3С.2a1b + Т131К (референс-штамм A/Южная Австралия/34/2019), 13 вирусов – к генетической подгруппе 3С.2а1b + T135K-B (референс-штамм A/Гонконг/2675/2019). Только один вирус A(H3N2) был подобен штамму A/Канзас/14/2017, введенному в состав вакцин на текущий сезон (клайд 3С.3а). Абсолютное большинство из 161 секвенированных вирусов гриппа типа В относилось к клайду 1А (del162-164) Викторианской линии (референс-вирус В/Вашингтон/02/2019). Один вирус гриппа В относился к клайду 3 Ямагатской линии (референс-штамм B/Пхукет/3073/2013).

Чувствительность к химиопрепаратам: Проведено изучение чувствительности 453 вирусов гриппа, в том числе 173 вируса A(H1N1)pdm09, 81 вирус А(H3N2) и 199 вирусов гриппа типа В, к ингибиторам нейраминидазы (озельтамивир, занамивир). Все изученные вирусы были чувствительны к нейраминидазным ингибиторам, за исключением одного штамма вируса гриппа типа В, имеющего сниженную чувствительность к занамивиру.

COVID-2019. По данным на 13.05.2020 в РФ зарегистрировано 242 271 случай COVID-2019 инфекции. Кроме того, согласно поступившей информации на 19 неделе, в системе надзора за гриппом и ОРВИ, по результатам ПЦР анализа клинических образцов от 11268 пациентов в городах - опорных базах НЦГ, коронавирус SARS-CoV-2 обнаружен в 855 случаях.

ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 6.9%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 18.7%.

В системе Сигнального надзора в 7 городах выявлено 190 больных ТОРИ, обследовано 18 больных ТОРИ, случаев гриппа не зарегистрировано. 1 случай ТОРИ во Владивостоке был обусловлен новым коронавирусом SARS-CoV-2. Два (11.1%) случая ТОРИ были обусловлены риновирусной инфекцией.

При обследовании 4 амбулаторных больных ГПЗ/ОРИ грипп не диагностирован. Случаев заболеваний негриппозной этиологии не зарегистрировано.

Эпидемиологические данные

На 19 неделе 2020 г. эпидемические пороги заболеваемости гриппом и ОРВИ не были превышены ни в одном из 61 города.

Лабораторными методами грипп выявлен в 4 городах из 35, приславших данные (см. карту).

На 19 неделе 2020 г. уровень заболеваемости населения в целом по стране понизился, по сравнению с предыдущей неделей и, составив 20.2 на 10 000 населения, был ниже базовой линии (72.4) на 72.0% и ниже еженедельного эпидемического порога на 56.4%.

На 19 неделе 2020 г. частота клинически диагностированного гриппа понизилась, по сравнению с предыдущей неделей и составила 0.00166 на 10 000 населения, что в 36.7 раза ниже предэпидемической базовой линии (0.061).

На 19 неделе частота госпитализации с диагнозом "грипп" понизилась, по сравнению с предыдущей неделей и, составив 0.00148 на 10 000 населения, была в 31.1 раза ниже предэпидемической базовой линии (0.046).

Результаты лабораторной диагностики

Лабораторными методами на 19 неделе при исследовании материалов от 1563 больных гриппом и ОРВИ в 35 городах зарегистрировано 5 (0.3%) случаев гриппа в 4 городах, в том числе 2 случая гриппа A(H1N1)pdm09 в 2 городах, 1 случай гриппа типа A(H3N2) в 1 городе и 2 случая гриппа типа В в 1 городе.

На 19 неделе в клеточной культуре МDCK выделено 16 вирусов гриппа, в том числе 7 вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, 3 вируса гриппа A(H3N2) и 6 вирусов гриппа типа В. Всего с начала сезона выделено 1316 вирусов гриппа, в том числе 500 вирусов А(H1N1)pdm09, 253 вирусов A(H3N2) и 563 вируса гриппа типа В.

Антигенная характеристика. С начала сезона в НЦГ в Москве и Санкт-Петербурге антигенно охарактеризовано 736 вирусов гриппа, в том числе 320 вирусов A(H1N1)pdm09, 111 вирусов A(H3N2) и 305 вирусов гриппа типа В, выделенных в разных городах страны. Все штаммы A(H1N1)pdm09 антигенно подобны современному вакцинному штамму A/Brisbane/02/2018, за исключением 8 вирусов гриппа A(Н1N1)pdm09, взаимодействующих с антисывороткой к вакцинному штамму в сниженных титрах; 88 вирусов гриппа A(H3N2) были подобны референс-штамму A/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016, 4 штамма - его дрейф варианты, 4 вируса близкородственны современному вакцинному штамму А/Канзас/14/2017. 302 вируса гриппа В принадлежали Викторианской линии, 39 из них были антигенно близкородственны вакцинному штамму В/Колорадо/06/2017, 41 штамм оказался его дрейф-вариантом, 202 вируса были подобны вакцинному штамму  В/Вашингтон/02/2019, 20 штаммов определены как его дрейф-варианты. 3 вируса гриппа типа В были отнесены к линии Ямагата и подобны референс штамму В/Пхукет/3073/2013.

Генетический анализ.  В Национальном Центре по гриппу (Санкт-Петербург) отсеквенировано 442 вируса гриппа. По данным филогенетического анализа 244 вируса гриппа A(H1N1)pdm09 были отнесены к генетической подгруппе 6B.1A5 (референс-штамм A/Норвегия/3433/2018), 1 вирус – к генетической подгруппе 6B.1A7 (референс-штамм А/Словения/1489/2019). 21 вирус гриппа подтипа A(H3N2) отнесен к генетической подгруппе 3С.2a1b + Т131К (референс-штамм A/Южная Австралия/34/2019), 13 вирусов – к генетической подгруппе 3С.2а1b + T135K-B (референс-штамм A/Гонконг/2675/2019). Только один вирус A(H3N2) был подобен штамму A/Канзас/14/2017, введенному в состав вакцин на текущий сезон (клайд 3С.3а). Абсолютное большинство из 161 секвенированных вирусов гриппа типа В относилось к клайду 1А (del162-164) Викторианской линии (референс-вирус В/Вашингтон/02/2019). Один вирус гриппа В относился к клайду 3 Ямагатской линии (референс-штамм B/Пхукет/3073/2013).

Чувствительность к химиопрепаратам: Проведено изучение чувствительности 453 вирусов гриппа, в том числе 173 вируса A(H1N1)pdm09, 81 вирус А(H3N2) и 199 вирусов гриппа типа В, к ингибиторам нейраминидазы (озельтамивир, занамивир). Все изученные вирусы были чувствительны к нейраминидазным ингибиторам, за исключением одного штамма вируса гриппа типа В, имеющего сниженную чувствительность к занамивиру.

ОРВИ. Частота диагностирования ОРВИ негриппозной этиологии (парагрипп, аденовирусная, респираторно-синцитиальная, коронавирусная, бокавирусная, метапневмовирусная и риновирусная инфекция) составила по результатам ПЦР 6.9%, по результатам ИФА (парагрипп, аденовирусная и респираторно-синцитиальная инфекция) 18.7%.

Таблица 1. Результаты ПЦР диагностики в базовых лабораториях двух НЦГ ВОЗ в РФ за 19 неделю 2020г.

Таблица 2. Результаты выделения вирусов гриппа в базовых лабораториях двух НЦГ ВОЗ в РФ за 19 неделю 2020г.

Сигнальный надзор

В системе Сигнального надзора в 7 городах выявлено 190 больных ТОРИ, обследовано 18 больных ТОРИ, случаев гриппа не зарегистрировано. 1 случай ТОРИ во Владивостоке был обусловлен новым коронавирусом SARS-CoV-2. Два (11.1%) случая ТОРИ были обусловлены риновирусной инфекцией.

При обследовании 4 амбулаторных больных ГПЗ/ОРИ грипп не диагностирован. Случаев заболеваний негриппозной этиологии не зарегистрировано.

Примечание: Сводка по ситуации в России составлена на основе данных 51 опорной базы ФГБУ «НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России и 10 опорных баз ФГБУ «НИЦЭМ им.Н.Ф.Гамалеи» Минздрава России

Ситуация в зарубежных странах

Информация по гриппу за период 13.04-26.04.2020 была опубликована на сайте WHO (Update от 11.05.2020 367), за период 27.04-03.05.2020 - на сайтах FluNet и Европы (Flu News Europe), за период 26.04-02.05.2020 - на сайтах США (FluView) и Канады (FluWatch).

По данным FluNet в 71 стране мира было лабораторно подтверждено 325 случаев гриппа, из них 58.2% составил грипп А и 41.8% - грипп В. При субтипировании вирусов гриппа А в 58.2% случаев были выявлены вирусы гриппа A(H1N1)pdm09, в 41.8% - вирусы гриппа А(H3N2). Из изученных вирусов гриппа В 14.3% штаммов были отнесены к линии Ямагата, 85.7% штаммов - к Викторианской линии.

По данным ВОЗ от 11.05.2020 с 31.12.2019 г. в мире ВОЗ официально подтверждено 4 006 257 случаев новой коронавирусной инфекции (COVID-19) у людей, в том числе 278 892 (7.0% от числа заболевших) случая со смертельным исходом. Наибольшее число заболевших зарегистрировано в Европейском регионе - 1 731 606 случаев, в том числе 156 603 (9.0% от числа заболевших) случаев с летальным исходом.

По данным ВОЗ от 05.05.2020 г. в Саудовской Аравии с 01.03 по 31.03.2020 зарегистрировано 15 новых случаев MERS-CoV, в том числе 5 случаев со смертельными исходами. В целом на 31.03.2020 г. в мире зарегистрировано 2553 случая MERS-CoV инфекции среди людей, из которых 876 (34.3%) закончились летальным исходом.

Северное полушарие.

Европа. По данным Flu News Europe на 18 неделе активность вирусов гриппа в целом в странах Европы понизилась, по сравнению с предыдущей неделей. В одной стране Европейского региона (Ирландия) зарегистрировано региональное распространение, в 2 странах - спорадические случаи ГПЗ. В целом, в системе Сигнального надзора за неделю диагностирован один случай гриппа типа В.

Недозорными источниками за неделю с 20 по 26 апреля было диагностировано 16 случаев гриппа, в том числе грипп А - в 8 случаях, из них грипп A(H1N1)pdm09 - в 5, в 3 случаях вирусы гриппа А не были субтипированы. Грипп В был диагностирован в 8 случаях.

С 40 недели 2019 года генетически охарактеризованы 962 штамма A(H1N1)pdm09, 1032 вируса А(H3N2) и 693 вируса гриппа В. Все вирусы гриппа A(H1N1)pdm09 были подобны штамму A/Brisbane/02/2018, введенному в состав вакцин на сезон 2019-20 (генетическая подгруппа 6В.1A1). 81 штамм А(H3N2) были подобны штамму A/Hong Kong/2675/2019 (3C.2a1b+T135K-B), 554 вируса - вакцинному штамму A/Kansas/14/2017 (3C.3a), 64 штамма отнесены к подгруппе A/La Rioja/2202/2018 (3C.2a1b+T135K-A), и 332 вируса - к подгруппе A/South Australia/34/2019 (3C.2a1b+T131K). 26 из 28 вирусов гриппа В Ямагатской линии были подобны вакцинному штамму B/Phuket/3073/2013. Из 665 вирусов гриппа В Викторианской линии 601 штамм были подобны референс штамму В/Washington/02/2019, 19 вирусов - вакцинному штамму B/Colorado/06/2017 и 5 вирусов - вакцинному штамму B/Hong Kong/269/2017. Из 1676 исследованных вирусов 3 вируса A(H1N1)pdm09 и один вирус А(H3N2) имел пониженную чувствительность к озельтамивиру и занамивиру.

США. По данным СDС активность вирусов гриппа понизилась по сравнению с предыдущей неделей. Частота регистрируемых ГПЗ (1.5%) была ниже базовой линии (2.4%). В 7 штатах и Пуэрто-Рико была зарегистрирована локальная активность вирусов гриппа. Лабораториями служб здравоохранения грипп выявлен в 25 случаях, из них грипп A(H1N1)pdm09 - в 23, грипп В - в 2 случаях. Уровень смертности от гриппа и пневмонии (7.4%) был выше эпидемического порога (6.7%). На 18 неделе было зарегистрировано 4 случая смерти детей, связанных с гриппом, в том числе 3 случая - с гриппом A(H1N1)pdm09 и один случай с гриппом В.

С 29.09.2019 по 11.04.2020 г. антигенно/генетически охарактеризованы 896 штаммов A(H1N1)pdm09, 510 штаммов А(H3N2) и 1057 вирусов гриппа В. Все вирусы A(H1N1)pdm09 были подобны штамму A/Brisbane/02/2018, введенному в состав гриппозных вакцин на сезон 2019-20. По данным генетического анализа 94.1% А(H3N2) принадлежали к генетической группе 3С.2а1 и только 5.9% - к генетической группе 3С.3а, к которой относится штамм A/Kansas/14/2017, введенный в состав вакцин. По данным антигенного анализа 46.5% проанализированных штаммов были антигенно подобны штамму A/Kansas/14/2017. По данным генетического анализа 6.2% вирусов гриппа В подобны штамму B/Colorado/06/2017, относящемуся к генетической группе V1A.1. Большинство охарактеризованных вирусов (93.8%) относились к генетической группе V1A.3. По данным антигенного анализа 59.7% охарактеризованных штаммов были антигенно подобны штамму, введенному в состав вакцин B/Colorado/06/2017. 92 (8.7%) вируса гриппа В были подобны вакцинному штамму B/Phuket/3073/2013 Ямагатской линии. Все исследованные вирусы были чувствительны к озельтамивиру и занамивиру, кроме 7 штаммов A(H1N1)pdm09, резистентных к озельтамивиру и пирамивиру и 2 штамма гриппа В Викторианской линии, со сниженной чувствительностью к ингибиторам нейраминидазы.

Канада. По данным FluWatch активность вирусов гриппа понизилась, по сравнению с предыдущей неделей. Лабораторными методами за неделю диагностировано 13 (0.1% от числа обследованных) случаев гриппа, из них грипп А – в 4 случаях. Грипп В диагностирован в 9 случаях.

С 01.09.2019 г. антигенно/генетически охарактеризованы 614 штаммов A(H1N1)pdm09, 208 штаммов А(H3N2) и 664 вируса гриппа В. 50% вирусов A(H1N1)pdm09 были подобны вакцинному штамму A/Brisbane/02/2018, введенному в состав гриппозных вакцин на сезон 2019-20 годов, 50% штаммов взаимодействовали с антисывороткой к нему в сниженных титрах. По данным генетического анализа 98% вирусов А(H3N2) принадлежали к генетической группе 3С.2а1b. По данным антигенного анализа 78% вирусов A(H3N2) антигенно отличались от штамма, введенного в состав вакцин A/Kansas/14/20, относящегося к генетической подгруппе 3С.3а. Только 22 штамма A(H3N2) были отнесены к генетической подгруппе 3С.3а. По данным генетического анализа 481 охарактеризованных штамма гриппа типа В Викторианской линии относились к генетической группе V1A.3. По данным антигенного анализа 90% вирусов антигенно отличались от вакцинного штамма В/Колорадо/06/17. 2 вируса гриппа В были подобны вакцинному штамму B/Phuket/3073/2013 Ямагатской линии. Все исследованные вирусы были чувствительны к озельтамивиру и занамивиру, кроме одного штамма A(H1N1)pdm09, резистентного к озельтамивиру.